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第142章 这不是高中兴趣小组(求订阅求月票)
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    林允宁挂掉电话,对面的埃米特和玛利亚都看了过来。

    “出什么事了?”

    玛利亚察觉到他表情的变化。

    “没什么,”

    林允宁站起身,将杯里最后一口苹果西打喝完,“医学院那边有点事,我得过去一趟。”

    他抓起背包,对两人点了点头,快步走出咖啡馆。

    从神学院地下室出来,午后的阳光正好。

    林允宁没有骑车,而是选择步行。

    他需要一点时间,来整理思绪。

    芝加哥大学的校园,像是被一条无形的线分成了两个世界。

    神学院所在的西区,是哥特式的尖顶和爬满常春藤的石墙,古老而静谧。

    而医学院所在的东区,则是一栋栋由玻璃和钢筋构成的现代建筑,实用、冰冷,充满了功能主义的气息。

    他穿过中心草坪时,看到几个本科生正在玩飞盘,年轻的脸上满是无忧无虑的笑容。

    这让他想起了宋子阳,不知道那家伙的二模成绩怎么样了。

    医学院的生物科学研究大楼门口,程新竹正焦躁地来回踱步,时不时看一眼手腕上那块粉色的卡西欧手表。

    看到林允宁的身影,她立刻迎了上来,脸上写满了紧张。

    “怎么办?我老板的语气听起来....……很不好。”

    她压低声音,像是在说什么机密。

    “兵来将挡。”

    林允宁的回答很简单。

    格林伯格教授的办公室在顶楼,视野极好,可以将整个海德公园的景色尽收眼底。

    两人站在门口,程新竹深吸了好几口气,才抬手敲了敲那扇厚重的橡木门。

    “请进。”

    门里传来一个沉稳的男声。

    办公室里,格林伯格教授正坐在他那张巨大的办公桌后,戴着金丝眼镜,审视着电脑屏幕上的数据。

    他没抬头,只是指了指对面的两张椅子。

    “坐。”

    程新竹像个犯了错的小学生,拉开椅子,只坐了前半边,双手紧张地放在膝盖上。

    林允宁则平静地坐下,将背包放在脚边。

    格林伯格没有立刻开口,办公室里只有电脑主机轻微的嗡鸣声。

    这种沉默的压力,比任何严厉的训斥都更让人难熬。

    程新竹的头越理越低,几乎要缩进领子里。

    终于,格林伯格移动鼠标,关掉了屏幕上的窗口,抬起头。

    他先是看向程新竹,语气不带任何感情,像在宣读一份实验报告。

    “瑞秋,我有没有告诉过你,医学院的计算集群,每一小时的机时费,都来自于国家卫生研究院的科研经费,或者校友的慷慨捐赠?

    “在没有经过反复论证的前提下,调用超过十万个cpu小时,去进行一次近乎于‘暴力破解”的计算,这种行为,是对科研资源的滥用。”

    “对不起,教授,我......”

    程新竹的声音细若蚊蝇。

    “这不是你一个人的问题,’

    格林伯格的目光又转向林允宁,“林同学,这个想法,是你提出来的吧?我听说你是物理系劳拉?宋教授的客人。但这并不能成为你参与并主导这次违规操作的理由。”

    他顿了顿,身体微微前倾,镜片后的眼神很锐利。

    “我承认你的想法很大胆,也很有想象力。但我还是要批评你们。科学研究不是碰运气,严谨的流程和清晰的假设,是通往真理的唯一路径。

    “这里是芝加哥大学,不是你们高中的物理兴趣小组,我们也不是在大西洋城的赌场碰运气,而是在做研究。在我的实验室,我们遵守规则。懂吗?”

    “我明白,教授。”

    林允宁点了点头,平静地接受了批评,“这件事由我而起,责任在我。

    看到林允宁主动揽责,格林伯格的表情没有丝毫变化。

    他靠回椅背,双手交叉放在桌上。

    “但是,”

    他话锋一转,“我看了你们昨晚提交的初步报告。我必须承认,在项目被叫停而且资源被切断的情况下,你们没有放弃,而是想办法用有限的资源继续推进。这种执着的精神,我必须给予肯定。”

    程新竹猛地抬起头,有点不敢相信自己的耳朵。

    “现在,我想听听,”

    格林伯格的目光锁定在林允宁身上,“你那个所谓的“构象反向传播,到底是什么东西。用我能听懂的语言,解释一下。”

    林允宁知道,真正的考验来了。

    他没有去碰电脑,而是站起身,走到办公室角落那块小小的白板前,拿起一支笔。

    “教授,我们之前的思路,是‘积分”。就像知道了一个物体的初始位置和受力,去计算它未来的运动轨迹。但蛋白质的构象空间太复杂,计算量是天文数字,所以我们失败了。”

    “所以你们换了思路。”格林伯格接话。

    “对。我们换成了‘反演’。”

    林允宁的思路很清晰,“我们不再关心它‘将要去哪,而是根据它‘最终在哪’,来反推它‘最可能从哪来''。”

    他看着格林伯格的眼睛,用了一个更精确的比喻。

    “这本质上是一个信息重构问题。我们手里有几万张分辨率极高的‘藏宝图碎片,也就是处理过后的冷冻电镜图像。

    “我的算法,就是一套寻找‘最经济的拼接方式’的规则。

    “它会不断尝试各种拼接的可能性,每拼接一块,就计算一次当前这幅画的‘信息熵'',或者说‘混乱程度”。然后,它会永远选择让整幅画变得更清晰,更符合物理规律的那一种拼接方案。”

    格林伯格静静地听着,脸上的表情从审视,慢慢变成了凝重。

    他追问了一个核心问题:

    “你怎么定义''更符合物理规律?这是关键。否则,你的算法只会给你一条数学上最漂亮,但生物学上毫无意义的曲线。

    “我们用了两个强约束,”

    林允宁回答,“第一,路径在能量上必须是连续下降的,不能凭空翻越无法逾越的能垒。

    “第二,路径上的每一个中间态,它的二维投影,必须能在您那几万张实验图像中,找到统计意义上高度相似的匹配。

    “我们用实验数据,给这个数学模型,制定了一个‘罗盘''。”

    话音落下。

    办公室里陷入了长久的沉默。

    格林伯格没有说话,他只是摘下眼镜,用指节用力按压着眉心。

    他站起身,在巨大的落地窗前踱步,然后猛地转过身,眼神里是一种林允宁从未见过的、混杂着震惊与兴奋的光芒。

    “把你的电脑连上投影。”

    他用不容置疑的语气说道。

    林允宁将笔记本接上投影仪,屏幕上出现了那条穿越了上千个数据点的红色轨迹。

    “很好”

    格林伯格走到屏幕前,指着轨迹中间那个突兀的“尖峰”,“把这个过渡态结构,单独渲染出来。”

    林允宁敲了几个命令,那个结构极其扭曲的蛋白质三维模型,出现在幕布上。

    格林伯格死死地盯着那个模型,像是要把它的每一个原子都看穿

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